Hamilton je koristio supermekane gume u prvim krugovima trećeg dijela kvalifikacija kada je vozio brže po krugu za 0,229 sekundi u odnosu na timskog kolegu iz Mercedesa Valtterija Bottasa. Taj krug s vremenom 1:27,760 je bio dovoljan da Britanac osigura pole poziciju, a tokom kvalifikacija je pala i kiša.
Ferrarijevi vozači Sebastian Vettel i Kimi Raikkonen su poslani na stazu sa intermediate setom guma na startu trećeg dijela kvalifikacija jer su očekivali da će kiša početi ranije. Obojica su se morali vratiti u boks po slikove, što znači da su prve krugove pravili na rubu kiše. Dok je Raikkonen uspio postaviti vrijeme kruga 1:29,521 i osigurati četvrtu startnu poziciju iza Red Bullovog vozača Maxa Verstappena, Vettelu je "ponestalo staze" u zavoju Spoon Curve pa je krug završio s vremenom 1:32,192.
Haasov vozač Romain Grosjean je bio jedini vozač u top 10 sa mekanom mješavinom guma te je osvojio petu startnu poziciju.
Poredak kvalifikacija za Veliku nagradu Japana: