Kako se navodi u optužnici, Popović se tereti da je tokom rata u BiH u svojstvu načelnika SJB Mrkonjić Grad, kao nadređena osoba pripadnicima aktivnog i razervnog sastava milicije SJB Mrkonjić Grad, postupao protivno odredbama Međunarodnog humanitarnog prava i Ženevskih konvencija o zaštiti civilnih osoba za vrijeme rata.
"U mjesecu junu 1992. godine, kada je u prostorijama SJB Mrkonjić Grad, kao i u prostorijama firme “Udarnik” u mjestu Bjelajce i prostorijama firme “Zadružna trgovina” u mjestu Podbrdo, nezakonito bio zarobljen veći broj osoba, civila bošnjačke i hrvatske nacionalnosti, među kojima i malodobnih osoba i žena, optuženi dozvoljavao pripadnicima SJB, vojnicima i drugim osobama, ulazak u navedene prostorije, gdje su vršili teška premlaćivanja, zlostavljanja i mučenja zarobljenika, nanošenje teških tjelesnih i duševnih ozlijeda sa trajnim posljedicama, mučenja na ponižavajuće načine i druga nečovječna djela", navodi se u optužnici.
Istaknuto je da je od posljedica višednevnog i ponovljenog mučenja i zlostavljanja, jedan zarobljenik preminuo a većem broju nanesene su trajne i teške ozlijede.
"Optuženi se tereti da nije poduzeo nužne i razumne mjere, da kao nadređena osoba spriječi počinitelje u počinjenju ubistva i teškog zlostavljanja civila, te iako je znao da su zločini počinjeni, nije ništa poduzeo da se počinitelji procesuiraju i kazne za počinjene zločine. Optuženi se tereti za kazneno djelo ratni zločin protiv civilnog stanovništva iz članka 173. Kaznenog zakona Bosne i Hercegovine. Navode optužbe tužiteljstvo će dokazivati pozivanjem većeg broja svjedoka, među kojima i žrtava i oštećenih, te prilaganjem velikog broja materijalnih dokaza", ističe se u optužnici.
Optužnica je proslijeđena Sudu BiH.
