MBO su osnovali Tunjo Filipovic i Adil Zulfikarpasic kada su napustili SDA 1990-te godine. Alija se ogradjivao od pojma "Bosnjak" sve do 93-ce a onda ga je napokon prihvatio i prvi Muslimanski svjetski kongres nazvao Bosnjackim racunajuci da ce tako lakse doci do svoje nacionalne drzave. Tada su odlucili da su se tako oduvjek zvali. Zatim je pocela islamizacija ARBiH i otklonila svaka sumnja da je to bio gradjanski rat a ne nekakva agresija. Muslimani i Hrvati potom razvezase zastave.