Zelene beretke su na početku Rata u Bosni i Hercegovini, u srpskim medijima, služile za zastrašivanje srpskog stanovništava od "muslimanskih jedinica". Ne postoje dokazi koji bi mogli utvrditi da su Zelene beretke kršile međunarodne konvencije o ratovanju. Organizacijom Armije Bosne i Hercegovine, ljudstvo iz ovih jedinica je prešlo u sastav regularne Armije Republike Bosne i Hercegovine da je i dalje brani od agresora i domaćih izdajnika.