Oslobađanje navedenih područja se smatra jednim od najznačajnijih pobjeda ARBiH. Komandovao je snagama koje su se borile protiv srpskih snaga, kao i protiv Hrvatskog vijeća odbrane (HVO).
Alagić je uz komandanta Petog korpusa ARBiH Atifa Dudakovića komandovao jedinicama koje su 1995. bile nadomak Banja Luke.
Po okončanju rata se penzionisao i postao prvi poslijeratni gradonačelnik Općine Sanski Most. Sa ove funkcije ga je 1999. smijenio visoki predstavnik Carlos Westendrop.
Pripadnici Federalne uprave policije (FUP) su ga dvije godine kasnije uhapsili, a nakon čega je transportovan u Hag jer je optužen za komandnu odgovornost za ratne zločine u srednjoj Bosni.
Pušten je da se brani sa slobode, a preminuo je 7. marta 2003. godine. Dženaza mu je klanjana u rodnim Fajtovcima pred nekoliko hiljada ljudi.