Drugi najprodavaniji Škodin model premijerno je predstavljen 1999. godine. Uz manji redizajn prva se generacija Fabije proizvodila do 2007. godine, a s proizvodnih traka sišlo je 1.790.000 primjeraka.
Druga generacija stigla je do 1.710.000 kupaca, a s aktuelnom trećom generacijom Fabije koja se proizvodi od 2014. godine Škoda je stigla do četiri miliona proizvedenih primjeraka automobila koji neke elemente dijele s modelima SEAT Ibiza i VW Polo.
Posljednje promjene na aktuelnoj generaciji odnose se na uvođenje novog litarskog trocilindarskog turbo benzinskog motora (110 KS) s kojim je zamijenjen 1,2-litarski TSI motor. Novi aluminijski motor je 6 posto štedljiviji i 10 kilograma lakši, a istovremeno raspolaže s više snage i obrtnog momenta u odnosu na stari motor.
Redizajnirano izdanje treće generacije očekuje se naredne godine.