On je u molbi upućenoj Carmelu Agiusu, predsjedniku Međunarodnog mehanizma za krivične sudove (MMKS) naveo da je odslužio dvije trećine kazne.
Stojić je osuđen na 20 godina zatvora u okviru postupka "Jadranko Prlić i ostali". Tužilaštvo je 29. novembra 2017. potvrdilo presudu Stojiću i još peterici bivših zvaničnika tzv. Herceg-Bosne, koji su bili optuženi za zločine protiv čovječnosti, u zločinačkom poduhvatu etničkog čišćenja bosanskih muslimana.
Bivši funkcioneri tzv. Herceg-Bosne Jadranko Prlić, Bruno Stojić, Slobodan Praljak, Milivoj Petković, Valentin Ćorić i Berislav Pušić osuđeni na kazne zatvora u trajanju od 10 do 25 godina.
Njegova advokatica Senka Nožica u podnesku je navela da s obzirom na godine starosti i ponašanje u pritvoru njegovo puštanje na slobodu ne predstavlja rizik. Također, ona je navela da bi Stojić na slobodi boravio u Zagrebu.
